公司2009年进行股改，设立长久股权、技术项目股权、经营股权，多名总部、子公司、工厂的高管成为东阳光的股东；从而建立了一个法制化管理，研发体系完善，恒产者有恒心的现代企业。东阳光在2005年成立了研究总院，下设东阳光科和东阳光药两个研究院；东阳光科研究院下设新材料、新能源、电子材料三大研究所；在新材料、智能器件、氟硅铝领域拥有了系统的研发能力，建立了两个博士后工作站、***技术中心；现在研项目共有28个；东阳光药研究院下设专利新药、生物药、仿制药三大研究所；是中国装备精良、人才尖端、人数众多、实力强大的新药、生物药、仿制药研发基地；建立了符合美国fda和欧洲新药标准的研发体系；是一个高度国际化、具备国际级研发水平、中国实力最强、规模最大的药物研发机构，现有研发项目200余个；研究院拥有5万﹐规范实验室，20台液质联用仪器、2台核磁共振、400多台高效液相色谱和40多台气相色谱，以及xrd衍射仪、拉曼光谱仪、在线晶型粒径分析仪等多种世界最先进、最配套的检测仪器；研究院建立了科学、完善的研发管理体系：在行政上设立了纵向的原创部、药理部、临床部、制剂部、法规部、知识产权部、dqa等部门；以及横向的项目组的管理体制，部以硬件和软件建设为中心，项目组以推进单个项目的进度为中心，有分有合交替发展；可以全程独立地进行专利新药、生物药、仿制药的研发；研究院共有1600余名研发人员，40多名外籍和海归专家，100余名博士，1000余名硕士，更能持续发展的是拥有20余名国际级的化学结构创造师，药物化学能力世界一流、中国第一；
